Nástroj nabízí dva způsoby podpisu. První je založený na funkcích Java a druhý potřebuje jen funkce prohlížeče..

Pro první způsob je potřeba mít nainstalovanou a správně nastavenou Javu na počítači a platný a správně nainstalovaný kvalifikovaný certifikát v systémovém úložišti. Nástroj vygeneruje a automaticky stáhne soubor JNLP. Tento je potřeba spustit, vybrat požadovaný certifikát z nabídky a potvrdit podepsání.

Pro přípravu prostředí je potřeba:
• Nainstalovanou Javu verze 8 v 32 bitové i 64 bitové verzi.
• Nastavení High Security a přidaný nástroj mezi důvěruhodné (Java → Configure Java → Security → Edit Site List → Add → zde vložit – https://projekt.profilzadavatele-vz.cz → OK).
• Kvalifikovaný certifikát v systémovém úložišti.

Druhý způsob využívá standardní funkce prohlížeče a kvalifikovaný certifikát uložený na disku. Tento způsob nevyžaduje žádné instalace ani konfigurace. Nástroj nabídne výběr souboru s certifikátem a následně jeho použítí k podpisu.